Os três diplomatas foram declarados "persona non grata" e intimados a abandonar o país em 48 horas, segundo uma nota do Ministério dos Negócios Estrangeiros datada de terça-feira e enviada à embaixada francesa.
De acordo com o ministério do Burkina, os diplomatas são Gwenaelle Habouzit, Herve Fournier e Guillaume Reisacher.
O Ministério dos Negócios Estrangeiros francês em Paris não comentou imediatamente as expulsões.
Desde que chegou ao poder num golpe de Estado em setembro de 2022, a junta liderada pelo capitão Ibrahim Traore distanciou o país da França, que governou o país até 1960.
O embaixador francês foi retirado após a tomada do poder pelos militares. Pouco depois o Burkina Faso cancelou um acordo militar de 1961 entre os dois países, ordenou a retirada das tropas francesas e passou a recorrer cada vez mais à Rússia para obter apoio em matéria de segurança.
Alguns meios de comunicação social franceses foram proibidos, enquanto a Rússia concordou em construir uma central nuclear para o país africano.
- Alegações de espionagem
No dia 1 de dezembro, quatro funcionários franceses foram detidos, acusados e encarcerados na capital Ouagadougou, segundo uma fonte francesa.
As autoridades burquinenses afirmaram que se tratava de agentes dos serviços secretos, mas a fonte francesa disse que se tratava de pessoal de apoio informático.
Os quatro estão agora em prisão domiciliária, de acordo com fontes de segurança do Burkina.
Em dezembro de 2022, Ouagadougou expulsou dois cidadãos franceses que trabalhavam para uma empresa do Burkina Faso por alegada espionagem.
A França pôs fim às missões militares anti-jihadistas no Mali e no Burkina Faso e, mais recentemente, começou a retirar forças do Níger - os três países onde as juntas governam atualmente na sequência de golpes de Estado.
Durante vários anos, os três países enfrentaram ataques jihadistas recorrentes de grupos ligados à Al-Qaeda e ao Estado Islâmico.
Só no Burkina Faso, cerca de 20.000 pessoas foram mortas e cerca de dois milhões de pessoas foram deslocadas desde 2015.
Os três regimes militares formaram um pacto económico e de defesa, a Aliança dos Estados do Sahel (AES), em setembro, e em fevereiro anunciaram a sua retirada do bloco da África Ocidental, a CEDEAO.
O Ministro da Defesa do Mali, Abdoulaye Diop, afirmou que a aliança é uma "combinação de esforços militares e económicos entre os três países" e que a sua prioridade é "lutar contra o terrorismo nos três países".